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鉆孔是某些動(dòng)物為了覓食、附著和藏身而打的洞。鉆孔經(jīng)常出現(xiàn)在化石化的貝殼、木頭和其它生物體的化石之上。鉆孔也是一種化石。象鉆孔蝸牛這種食內(nèi)動(dòng)物就能穿過(guò)其它動(dòng)物的殼來(lái)鉆孔以吃食其軟體部分。許多古代軟體動(dòng)物的殼上可見(jiàn)到象是鉆孔蝸牛打的整齊的洞。
化石對(duì)于追溯動(dòng)植物的發(fā)展演化是有用的，因?yàn)樵谳^老的巖石中的化石通常是原始的和較簡(jiǎn)單的，而在年代較新的巖石中的類似種屬的化石就要復(fù)雜和高級(jí)。
某些化石作為環(huán)境的指示物是很有價(jià)值的。例如造礁珊瑚似乎總是生活在與今天相似的條件下。因此，如果地質(zhì)學(xué)家找到了珊瑚礁化石——珊瑚最初被埋藏的地方，就可以有理由地認(rèn)為，這些含有珊瑚的巖石形成于溫暖的相當(dāng)淺的海中。這就使得勾畫出史前時(shí)期海的位置及范圍成為可能。珊瑚礁化石的存在還可指示出古代水體的深度、溫度、底部條件和含鹽度。
化石的一個(gè)更重要的用途是用來(lái)進(jìn)行對(duì)比——確定若干巖層間彼此相互關(guān)系的密切的程度。通過(guò)對(duì)比或比較各巖層所含的特征化石，地質(zhì)學(xué)家可以確定一個(gè)特定區(qū)域的某種地質(zhì)建造的分布。有的化石在地質(zhì)歷史上生存的時(shí)間相當(dāng)短，然而在地理分布上卻相當(dāng)廣泛。這種化石被稱為指示化石。由于這種化石通常只是和某一特定時(shí)代的巖石共生，所以在對(duì)比中特別有用。
微體生物的化石對(duì)于石油地質(zhì)工作者作為指示化石特別有用。微體古生物學(xué)家（研究微體古生物的學(xué)者）通過(guò)對(duì)從鉆孔中取得的巖心進(jìn)行沖洗、將微小的化石分離出來(lái)，然后在顯微鏡下進(jìn)行研究。通過(guò)對(duì)這些細(xì)小的古生物遺體的研究所獲得的資料對(duì)于判斷地下巖層的年代和儲(chǔ)油的可能性是非常有價(jià)值的。微體古生物化石對(duì)于世界油田之重要可從某些儲(chǔ)油地層用某些關(guān)鍵的有孔蟲的屬來(lái)命名這一點(diǎn)見(jiàn)其一斑。其它微體古生物化石，例如：介形蟲、孢子和花粉，也被用來(lái)確定世界其它許多地區(qū)的地下巖層。
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