300多年前，A.van列文虎克用約放大270倍的透鏡，第一個(gè)看到了很多自由生活和寄生生活的原生動(dòng)物,他把眼蟲描述為“中間綠、兩端白”的蟲子,后人尊稱他為原生動(dòng)物學(xué)之父。
1758年C.von 林奈應(yīng)用雙名法命名了巨團(tuán)藻蟲，大巨變蟲。G.A.戈?duì)柕赂凰?817年第一年用Protozoa(原生動(dòng)物)一詞，但他把腔腸動(dòng)物也包括進(jìn)去。對(duì)原生動(dòng)物下了正確定義的是 C.T.E.von西博爾德(1845)。C.G.埃倫貝格1838年把觀察的原生動(dòng)物進(jìn)行分類描述，提出初步的分類系統(tǒng)。20世紀(jì)初，從原生動(dòng)物的經(jīng)典分類研究逐步擴(kuò)展到生理、營(yíng)養(yǎng)、生態(tài)、遺傳等領(lǐng)域。50年代起,由于電子顯微鏡的應(yīng)用，使原生動(dòng)物的研究進(jìn)入到亞顯微結(jié)構(gòu)的水平。
近十余年來，應(yīng)用顯微分光光度計(jì)、酶化學(xué)等方面的新技術(shù)，在分子水平上對(duì)原生動(dòng)物進(jìn)行微觀的研究。同時(shí)，通過應(yīng)用計(jì)算機(jī)模型，也對(duì)原生動(dòng)物的生態(tài)進(jìn)行了群落級(jí)的宏觀研究。
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